Cystoskopia v anestézii môže diagnostikovať intersticiálnu cystitídu. Spočiatku je vzhľad a kapacita močového mechúra v norme, ale po naplnení, vyprázdnení a opätovnom naplnení močového mechúra sa často pozorujú rozptýlené submukózne krvácania. Biopsia odhaľuje patologické zmeny v subepidermálnej vrstve vrátane edému, kongescie, teleangiektázie a perivaskulárneho intersticiálneho krvácania. Môže tiež pomôcť vylúčiť niektoré karcinómy in situ a tuberkulózne lézie. Pri lokalizovanej vulvitíde sú malé erytematózne lézie prítomné na laterálnom vestibule panenskej blany, zatiaľ čo zvyšok lézií je normálny.
Akútna cystitída sa tiež prejavuje príznakmi podráždenia močového mechúra, ako je frekvencia močenia, nutkanie na močenie a dyzúria. Bežná je však terminálna hematúria a moč obsahuje veľké množstvo bielych krviniek; kultivácia moču odhalí baktérie. Glandulárna cystitída sa tiež prejavuje príznakmi podráždenia močového mechúra, ako je časté močenie, nutkanie na močenie a dyzúria. Ultrazvukové vyšetrenie však môže odhaliť zhrubnutie steny močového mechúra alebo priestor{3}}zaberajúce lézie v močovom mechúre. Cystoskopia odhalí skôr papilárne štruktúry ako povrchové vredy a biopsia môže potvrdiť diagnózu. Tuberkulóza močového mechúra sa môže prejaviť aj ako pravé vredy, často postihujúce oblasť okolo ureterálneho ústia na strane tuberkulóznej obličky. Môže sa vyskytnúť pyúria a v moči možno nájsť tuberkulózne bacily. Zobrazovanie močových ciest môže ukázať typické zmeny charakteristické pre obličkovú tuberkulózu. Vredy močového mechúra spôsobené parazitárnymi ochoreniami pripomínajú intersticiálnu cystitídu a sú vo všeobecnosti bežnejšie u mužov. Diagnózu možno stanoviť na základe prítomnosti vajíčok parazitov v moči alebo typických patologických znakov močového mechúra. Nešpecifická cystitída sa zriedkavo prejavuje vredmi močového mechúra; v moči sa bežne nachádzajú hnisavé bunky a infekčné baktérie, účinná je antibiotická liečba.
